羊用B超机在绵羊兽医中的应用主要为检测母羊妊娠、确定胎儿数量和诊断子宫异常，例如子宫炎。对绵羊做超声检测使用更多的是扇形探头的羊用B超机，也有少部分客户喜欢使用直肠线阵探头的羊用B超机。
羊用B超机两种探头使用羊用B超机进行超声检查对小型反刍动物进行妊娠诊断是一种准确、快速和安全的方法，可用于早期发现妊娠。可以使用经直肠或经腹方法，灵敏度高。
羊用B超机测羊妊娠在实际检测中，经腹扫描更受青睐，因为腹部检测绵羊对其造成的影响较小，速度更快，并且扫描范围非常宽。而在妊娠40天之前，经直肠途径可提供更好的检测结果。最常用的频率范围为3.5至5.0MHz。在经直肠方法中，探头在直肠中插入约15厘米深度，直到膀胱成像。标准的牛线性阵列直肠探头可用于较大的母羊；通常通过使用引入杆来促进使用。然后将探头在膀胱左右两个方向上旋转90度，以识别两个子宫角。在经腹检查中，探头放置在乳腺前面，指向尾部，然后向尾部移动（进入腹股沟）以对膀胱进行成像。子宫通常立即出现在膀胱的头侧。右侧腹股沟和外周区域是首选，因为左侧经常被瘤胃占据。
检测到空怀母羊时需将这些空怀母羊重新进行配种或者淘汰以节省饲料成本。此外，在检查时发现未怀孕的母羊比例增加，需要调查原因。
羊用B超机检测的其他好处包括可以检测粗每只母羊的胎儿数量，这是对羊群非常重要的信息，因为这可以针对每组母羊的不同需求进行营养管理。它还可以估计妊娠阶段，有助于指导哺乳期母羊的干燥时间，尤其是在公羊与母羊长时间在一起的情况下。
最后，通过羊用B超机的超声检查进行妊娠诊断还有一个额外的优势，即潜在地能够识别死亡或垂死的胎儿、子宫蓄积或积水。
绵羊分娩前后，超声检查可用于检测子宫扭转（受影响的母羊出现第1期分娩迹象，但手不能伸入宫颈和子宫；子宫壁厚度从5毫米增加到10毫米以上），否则可能很难在绵羊中进行诊断，并且还无法明确检测宫颈闭合后是否存在滞留胎儿。